Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCKP06239 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCKP06239 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCKP06239 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCKP06239 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCKP06239 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCKP06239 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCKP06239 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCKP06239 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCKP06239 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCKP06239 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCKP06239 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCKP06239 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCKP06239 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCKP06239 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCKP06239 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCKP06239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCKP06239 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCKP06239 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCKP06239 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCKP06239 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCKP06239 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCKP06239 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCKP06239 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCKP06239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCKP06239 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCKP06239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCKP06239 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCKP06239 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCKP06239 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCKP06239 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCKP06239 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCKP06239 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCKP06239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCKP06239 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCKP06239 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCKP06239 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCKP06239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCKP06239 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCKP06239 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCKP06239 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCKP06239 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCKP06239 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCKP06239 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCKP06239 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCKP06239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCKP06239 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCKP06239 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCKP06239 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCKP06239 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCKP06239 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCKP06239 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCKP06239 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCKP06239 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCKP06239 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCKP06239 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCKP06239 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCKP06239 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCKP06239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCKP06239 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCKP06239 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCKP06239 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCKP06239 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCKP06239 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCKP06239 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCKP06239 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms