Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT1P04264 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT1P04264 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT1P04264 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT1P04264 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT1P04264 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT1P04264 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT1P04264 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT1P04264 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT1P04264 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT1P04264 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT1P04264 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT1P04264 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT1P04264 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT1P04264 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT1P04264 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT1P04264 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT1P04264 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT1P04264 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT1P04264 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT1P04264 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT1P04264 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT1P04264 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT1P04264 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT1P04264 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT1P04264 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT1P04264 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT1P04264 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT1P04264 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT1P04264 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT1P04264 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT1P04264 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT1P04264 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT1P04264 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT1P04264 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT1P04264 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT1P04264 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT1P04264 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT1P04264 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT1P04264 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT1P04264 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT1P04264 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT1P04264 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT1P04264 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT1P04264 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT1P04264 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT1P04264 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT1P04264 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT1P04264 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT1P04264 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT1P04264 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT1P04264 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT1P04264 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT1P04264 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT1P04264 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT1P04264 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT1P04264 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT1P04264 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT1P04264 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT1P04264 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT1P04264 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT1P04264 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT1P04264 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT1P04264 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT1P04264 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT1P04264 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT1P04264 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT1P04264 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT1P04264 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT1P04264 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT1P04264 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT1P04264 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT1P04264 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms