Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAF1P04049 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAF1P04049 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAF1P04049 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAF1P04049 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAF1P04049 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAF1P04049 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAF1P04049 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAF1P04049 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAF1P04049 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAF1P04049 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAF1P04049 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAF1P04049 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAF1P04049 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAF1P04049 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAF1P04049 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAF1P04049 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAF1P04049 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAF1P04049 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAF1P04049 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAF1P04049 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAF1P04049 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAF1P04049 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAF1P04049 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAF1P04049 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAF1P04049 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAF1P04049 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAF1P04049 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAF1P04049 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAF1P04049 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAF1P04049 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAF1P04049 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAF1P04049 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAF1P04049 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAF1P04049 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAF1P04049 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAF1P04049 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAF1P04049 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAF1P04049 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAF1P04049 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAF1P04049 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAF1P04049 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAF1P04049 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAF1P04049 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAF1P04049 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAF1P04049 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAF1P04049 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAF1P04049 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAF1P04049 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAF1P04049 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms