Protein–RNA interactions for Protein: P01871

IGHM, Immunoglobulin heavy constant mu, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMP01871 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHMP01871 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHMP01871 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHMP01871 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHMP01871 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHMP01871 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHMP01871 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHMP01871 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHMP01871 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHMP01871 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHMP01871 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHMP01871 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHMP01871 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHMP01871 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHMP01871 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHMP01871 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHMP01871 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHMP01871 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHMP01871 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHMP01871 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHMP01871 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHMP01871 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHMP01871 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHMP01871 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHMP01871 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHMP01871 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHMP01871 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHMP01871 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHMP01871 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHMP01871 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHMP01871 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHMP01871 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHMP01871 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHMP01871 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHMP01871 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHMP01871 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHMP01871 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHMP01871 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHMP01871 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHMP01871 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHMP01871 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHMP01871 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHMP01871 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHMP01871 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHMP01871 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHMP01871 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHMP01871 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHMP01871 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHMP01871 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHMP01871 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHMP01871 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHMP01871 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHMP01871 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHMP01871 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHMP01871 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHMP01871 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHMP01871 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHMP01871 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHMP01871 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHMP01871 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHMP01871 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHMP01871 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHMP01871 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHMP01871 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHMP01871 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHMP01871 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IGHMP01871 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHMP01871 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHMP01871 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHMP01871 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHMP01871 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms