Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX3O95076 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX3O95076 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX3O95076 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALX3O95076 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX3O95076 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX3O95076 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX3O95076 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX3O95076 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX3O95076 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX3O95076 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX3O95076 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX3O95076 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX3O95076 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX3O95076 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX3O95076 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX3O95076 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX3O95076 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX3O95076 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX3O95076 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX3O95076 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX3O95076 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX3O95076 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX3O95076 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX3O95076 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX3O95076 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX3O95076 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX3O95076 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX3O95076 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX3O95076 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX3O95076 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX3O95076 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms