Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX30O94993 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX30O94993 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX30O94993 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX30O94993 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX30O94993 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX30O94993 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX30O94993 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX30O94993 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX30O94993 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX30O94993 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX30O94993 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX30O94993 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX30O94993 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX30O94993 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX30O94993 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX30O94993 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX30O94993 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX30O94993 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX30O94993 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX30O94993 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX30O94993 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX30O94993 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX30O94993 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX30O94993 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX30O94993 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX30O94993 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX30O94993 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX30O94993 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX30O94993 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX30O94993 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX30O94993 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX30O94993 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX30O94993 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX30O94993 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX30O94993 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX30O94993 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX30O94993 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX30O94993 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX30O94993 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX30O94993 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX30O94993 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX30O94993 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX30O94993 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX30O94993 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX30O94993 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX30O94993 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX30O94993 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX30O94993 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX30O94993 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX30O94993 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX30O94993 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX30O94993 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX30O94993 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX30O94993 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX30O94993 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX30O94993 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX30O94993 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX30O94993 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX30O94993 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX30O94993 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX30O94993 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX30O94993 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms