Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL18O94889 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL18O94889 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL18O94889 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL18O94889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms