Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM4AO75164 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM4AO75164 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM4AO75164 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM4AO75164 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KDM4AO75164 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM4AO75164 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM4AO75164 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms