Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOL3O60936 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOL3O60936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOL3O60936 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOL3O60936 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOL3O60936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOL3O60936 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOL3O60936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOL3O60936 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOL3O60936 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOL3O60936 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOL3O60936 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NOL3O60936 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOL3O60936 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOL3O60936 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOL3O60936 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOL3O60936 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOL3O60936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOL3O60936 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOL3O60936 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOL3O60936 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOL3O60936 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOL3O60936 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOL3O60936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOL3O60936 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOL3O60936 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOL3O60936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOL3O60936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOL3O60936 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOL3O60936 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOL3O60936 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOL3O60936 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOL3O60936 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOL3O60936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOL3O60936 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOL3O60936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOL3O60936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOL3O60936 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOL3O60936 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOL3O60936 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOL3O60936 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOL3O60936 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOL3O60936 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOL3O60936 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOL3O60936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOL3O60936 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOL3O60936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOL3O60936 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOL3O60936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOL3O60936 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOL3O60936 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOL3O60936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOL3O60936 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms