Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEMFO60524 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEMFO60524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEMFO60524 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEMFO60524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEMFO60524 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NEMFO60524 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEMFO60524 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEMFO60524 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEMFO60524 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEMFO60524 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEMFO60524 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEMFO60524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEMFO60524 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEMFO60524 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEMFO60524 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEMFO60524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEMFO60524 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEMFO60524 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEMFO60524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEMFO60524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEMFO60524 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEMFO60524 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NEMFO60524 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEMFO60524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEMFO60524 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEMFO60524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEMFO60524 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEMFO60524 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEMFO60524 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEMFO60524 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEMFO60524 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEMFO60524 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEMFO60524 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEMFO60524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEMFO60524 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEMFO60524 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEMFO60524 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEMFO60524 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEMFO60524 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEMFO60524 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEMFO60524 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEMFO60524 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMFO60524 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMFO60524 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMFO60524 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMFO60524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEMFO60524 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEMFO60524 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEMFO60524 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEMFO60524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEMFO60524 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEMFO60524 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEMFO60524 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEMFO60524 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEMFO60524 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEMFO60524 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEMFO60524 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEMFO60524 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEMFO60524 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEMFO60524 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEMFO60524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMFO60524 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMFO60524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMFO60524 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMFO60524 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEMFO60524 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMFO60524 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMFO60524 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMFO60524 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMFO60524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEMFO60524 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEMFO60524 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms