Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTSS1O43312 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTSS1O43312 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTSS1O43312 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTSS1O43312 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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