Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNN4O15554 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNN4O15554 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNN4O15554 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNN4O15554 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNN4O15554 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1716.5 ms