Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2O14595 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2O14595 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTDSP2O14595 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2O14595 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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