Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227AF5H4B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM227AF5H4B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM227AF5H4B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM227AF5H4B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms