Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRABD2BA6NFA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABD2BA6NFA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABD2BA6NFA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABD2BA6NFA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms