Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms