Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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