Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD20A3Q5VUR7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD20A3Q5VUR7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms