Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EEA1Q15075 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EEA1Q15075 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
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