Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEST4Q8NFU0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEST4Q8NFU0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms