Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TK1P04183 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TK1P04183 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TK1P04183 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TK1P04183 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TK1P04183 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms