Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEFLP07196 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEFLP07196 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms