Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFLP07196 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEFLP07196 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFLP07196 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFLP07196 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFLP07196 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms