Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3M1Q9Y2T2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3M1Q9Y2T2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M1Q9Y2T2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M1Q9Y2T2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3M1Q9Y2T2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 597.5 ms