Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHLA3Q9XRX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHLA3Q9XRX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA3Q9XRX5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms