Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS3Q9UNS2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS3Q9UNS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS3Q9UNS2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPS3Q9UNS2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS3Q9UNS2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms