Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDV3Q9UKY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDV3Q9UKY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDV3Q9UKY7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDV3Q9UKY7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDV3Q9UKY7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms