Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPG2Q9UBF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPG2Q9UBF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPG2Q9UBF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG2Q9UBF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG2Q9UBF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG2Q9UBF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG2Q9UBF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms