Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A12Q9NXJ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A12Q9NXJ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms