Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRMT1Q9NXH9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRMT1Q9NXH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRMT1Q9NXH9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRMT1Q9NXH9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRMT1Q9NXH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms