Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPL40Q9NQ50 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL40Q9NQ50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL40Q9NQ50 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL40Q9NQ50 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL40Q9NQ50 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms