Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMURF1Q9HCE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMURF1Q9HCE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF1Q9HCE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMURF1Q9HCE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF1Q9HCE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms