Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELL3Q9HB65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELL3Q9HB65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ELL3Q9HB65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms