Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C5orf42Q9H799 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C5orf42Q9H799 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C5orf42Q9H799 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
C5orf42Q9H799 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
C5orf42Q9H799 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms