Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Y9

SLCO5A1, Solute carrier organic anion transporter family member 5A1, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO5A1Q9H2Y9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO5A1Q9H2Y9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO5A1Q9H2Y9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO5A1Q9H2Y9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLCO5A1Q9H2Y9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO5A1Q9H2Y9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms