Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIRPQ9GZT3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLIRPQ9GZT3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLIRPQ9GZT3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLIRPQ9GZT3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLIRPQ9GZT3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms