Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP2-1Q9BYU5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP2-1Q9BYU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP2-1Q9BYU5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms