Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNHG12Q9BXW3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNHG12Q9BXW3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms