Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM106CQ9BVX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM106CQ9BVX2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM106CQ9BVX2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM106CQ9BVX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms