Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RBM42Q9BTD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RBM42Q9BTD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RBM42Q9BTD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RBM42Q9BTD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RBM42Q9BTD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RBM42Q9BTD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RBM42Q9BTD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms