Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VRK1Q99986 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VRK1Q99986 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VRK1Q99986 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VRK1Q99986 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms