Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSRNP1Q96S65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSRNP1Q96S65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CSRNP1Q96S65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSRNP1Q96S65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CSRNP1Q96S65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CSRNP1Q96S65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CSRNP1Q96S65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms