Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms