Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPD52L3Q96J77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPD52L3Q96J77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPD52L3Q96J77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52L3Q96J77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms