Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPDA2Q8TDQ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA2Q8TDQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA2Q8TDQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms