Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK9Q8TD19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEK9Q8TD19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEK9Q8TD19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK9Q8TD19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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