Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE00

TMEM104, Transmembrane protein 104, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM104Q8NE00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TMEM104Q8NE00 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TMEM104Q8NE00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TMEM104Q8NE00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TMEM104Q8NE00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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