Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC5Q8NAU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC5Q8NAU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC5Q8NAU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC5Q8NAU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms