Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC89Q8N998 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC89Q8N998 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC89Q8N998 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC89Q8N998 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms