Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MSL3Q8N5Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MSL3Q8N5Y2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MSL3Q8N5Y2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MSL3Q8N5Y2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 499.8 ms